Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy (CIML)

De la dissection des programmes d’activation des lymphocytes T, B et NK à la structure tridimensionnelle du complexe récepteur T-peptide antigénique-CMH en passant par la composition du signal de mort délivré par les lymphocytes T cytotoxiques et l’analyse du lignage myéloide, les travaux des scientifiques du CIML auront contribué à établir les grands principes d’organisation du système immunitaire et ouvert la voie à de nouvelles solutions diagnostiques et thérapeutiques.
Au contact d’autres sciences, à l’interface du physiologique et du pathologique, les scientifiques du CIML tentent aujourd’hui de prédire et manipuler le système immunitaire en combinant, à l’ère de la génomique fonctionnelle et de la biologie systémique, les analyses in vivo et l’étude des patients.

lymphocyte, Natural killer, CMH, immunité, système immunitaire, immunologie,

Thématique(s) : Santé et sciences de la vie

Directeur(s) / Chef(s) : Philippe PIERRE

Adresse : Parc Scientifique et Technologique de Luminy 163 avenue de Luminy | Case 906, 13288 Marseille cedex 9, France

Site internet : http://www.ciml.univ-mrs.fr/fr


Pôle / Axe #1 :

Equipe de recherche :

Rôle des Interferons lambda dans les muqueuses

Expertises :

L’équipe a montré que IFN-lambda induit par les virus entériques dans un modèle
expérimental de colite réprime l’inflammation intestinale aigüe en agissant sur les fonctions des neutrophiles. Elle s’interesse aussi à démoontrer que l’IFN-lambda joue un rôle néfaste dans la
phase de guérison qui succède à la phase d’inflammation aigue dans l’intestin, et en disséque les mécanismes sous-jacents.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : épithélium, Interférons, système digestif, système immunitaire,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #2 :

Equipe de recherche :

Immunobiologie des cellules stromales

Expertises :

Etudie les fonctions immunorégulatrices des cellules stromales dans les organes lymphoïdes et le dialogue entre les cellule stromales et les macrophages dans les organes non lymphoïdes.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : cellules stromales, immunobiologie, organes lymphoïdes, ganglions lymphatiques, niche des macrophage, CX3CL1, IL34, CSF1, CSF2,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #3 :

Equipe de recherche :

Cellules dendritiques et défense antivirale

Expertises :

Etude des sous-ensembles de cellules dendritiques en tant que lien entre l’immunité innée et adaptative, détectant/répondant aux infections tôt tout en orchestrant les réponses des lymphocytes T en aval.
Nous essayons de démêler les aspects de la spécialisation fonctionnelle et de la régulation des sous-ensembles DC qui sont conservés entre les vertébrés supérieurs. Nous déployons un effort majeur pour accélérer le transfert des connaissances de la souris à l’homme afin d’accélérer les applications cliniques des découvertes fondamentales initialement réalisées chez la souris.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : cellules dendritiques, réponse immunitaire, lymphocyte T,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #4 :

Equipe de recherche :

L’immunité innée

Expertises :

Analyse des mécanismes moléculaires qui contrôlent la réponse immunitaire innée et délimitation des différentes voies de signalisation qui la contrôlent.Utilisation de la biologie cellulaire comme moyen de comprendre la relation intime entre les réponses immunitaires innées et la réparation tissulaire.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : Caenorhabditis elegans, immunité innée, Drechmeria coniospora,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #5 :

Equipe de recherche :

L’immunité des cellules B à l’infection

Expertises :

Etude des méthodes de contrôle du microenvironnement des ganglions lymphatiques dans l’ampleur des réponses des anticorps.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : Lymphocyte B, vaccination; cellule, ganglions lymphatiques, centres germinatifs,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #6 :

Equipe de recherche :

Immunologie et biologie des interactions hôte pathogène

Expertises :

Notre objectif est de comprendre comment les bactéries pathogènes intracellulaires atteignent leur niche de réplication et quelles sont les molécules bactériennes qui jouent un rôle dans le contrôle de la réponse immunitaire. Au cours des dix dernières années, nous nous sommes intéressés à caractériser les mécanismes d’interaction hôte-pathogène qui permettent aux bactéries d’établir une vie durable à l’intérieur de l’hôte. Des approches in vitro et in vivo ont été utilisées pour étudier le devenir de Salmonella, Mycobacterium et Brucella vivantes et de leurs produits dans les cellules hôtes, en particulier dans les macrophages et les cellules dendritiques.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : immunologie, cellules immunitaires, vacuole, immunologie alimentaire, système immunitaire, cellules dendritiques, macrophage, salmonella, mycobacterium, brucella, PipB2, SopD2, SifA, SKIP, TLR-4/MD2, Btp1,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #7 :

Equipe de recherche :

Dynamique de la membrane et signalisation du lymphocyte T

Expertises :

Compréhension du rôle de la dynamique et de l’organisation latérales membranaires dans la signalisation des lymphocytes T, en analysant les événements d’interaction/association moléculaire à des résolutions spatio-temporelles élevées. Un accent particulier est mis sur l’examen de la dynamique moléculaire dans la membrane plasmique pour initier et intégrer des stimuli extracellulaires.
Mise en œuvre d’une configuration d’imagerie par nanoscopie basée sur la détection de molécules uniques et des méthodes analytiques fiables et exploration de nouvelles méthodes de contraste basées sur l’optique non linéaire et le capteur de front d’onde haute résolution.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : Lymphocyte T, LCK, ZAP 70, membrane dynamique,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #8 :

Equipe de recherche :

Tolérance immunitaire et différenciation des cellules T

Expertises :

Comprendre les mécanismes de la tolérance des lymphocytes T afin de développer des stratégies innovantes pour prévenir et traiter les pathologies auto-immunes.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : lymphocyte T, pathologie auto-immune, Aire, Fezf2, mTEC, thymus, crosstalk thymique,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #9 :

Equipe de recherche :

Dissection génétique de la fonction des lymphocytes T et des cellules dendritiques

Expertises :

Notre laboratoire étudie les lymphocytes T et les cellules dendritiques (CD) car ils sont à la base de l’immunité adaptative. Dans le cas des cellules T, nous poursuivons la dissection génétique de l’architecture de la cassette de signalisation opérée par le récepteur des cellules T (TCR).
Elucider les mécanismes par lesquels, au cours des réponses physiologiques des cellules T induites par l’antigène, LAT conduit d’abord à l’activation d’effecteurs intracellulaires impliqués dans le métabolisme cellulaire, la division cellulaire, la motilité cellulaire, la survie cellulaire et la différenciation en cellules T effectrices, puis exerce avec un retard temporel un rétro-inhibition qui conduit à une atténuation rapide de la voie de signalisation TCR.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : lymphocyte T, syndrome hyperéosinophilique idiopathique, syndrome de Chusid, TCR, LAT,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #10 :

Equipe de recherche :

Immunologie intégrative des lymphocytes B

Expertises :

Notre projet repose sur l’analyse monocellulaire intégrative des cellules B (analyse parallèle du phénotype, des mutations BCR et du transcriptome) dans les cellules B GC de souris et humaines et leur descendance, afin de produire des modèles monocellulaires à haute résolution de changements transcriptionnels dans la GC. cellules B, et suivre la différenciation et la sortie des cellules B GC vers une descendance à longue durée de vie. À long terme, nous visons à intégrer une carte complète des changements phénotypiques et d’expression génique dans un modèle de dynamique et de différenciation des cellules GC B.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : cellules B, thérapies antitumorales, maladies infectieuses, centres germinatifs, immunologie intégrative, microenvironnemet,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #11 :

Equipe de recherche :

Instabilité génomique et hémopathies humaines

Expertises :

L’objectif fondamental de notre programme de recherche est de contribuer au suivi et au traitement de la prévention du cancer, à travers l’étude des dérégulations pathologiques de la différenciation lymphocytaire. Nous cherchons notamment à :

Déterminer la base de l’instabilité génomique et du cancer médiés par V(D)J
Décrypter la progression maligne par étapes menant au développement d’un lymphome/leucémie
Identifier les facteurs de risque et les biomarqueurs associés
Caractériser les réseaux oncogènes et les nouvelles cibles thérapeutiques
Définir des sous-groupes de patients qui pourraient bénéficier d’une thérapie ciblée

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : tumeur, cellules cancéreuses, lymphocyte B, plasticité génétique, cancer,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #12 :

Equipe de recherche :

Inflammation tissulaire et immunité

Expertises :

Notre objectif est d’étudier comment un tissu perçoit et détecte un stress, puis comment ce stress module les « décisions » du tissu, par exemple l’enclenchement du recrutement de cellules immunitaires.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : biologie, réaction immunitaire, immunologie, vanine-1, stress oxydatif, radicaux libre, inflammation tissulaire,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #13 :

Equipe de recherche :

Biologie des cellules dendritiques

Expertises :

Nous sommes donc experts dans l’isolement ou la différenciation in vitro de différentes lignées de DC murines et humaines. Nos recherches se concentrent sur le décryptage de l’ensemble des changements biochimiques se produisant lors de l’activation cellulaire par des microbes ou le stress, et comment une mauvaise régulation de ces voies moléculaires contribue à l’inflammation chronique, à l’auto-immunité ou au cancer. Notre travail fournit un nouveau cadre pour développer des stratégies thérapeutiques pour moduler la réponse immunitaire pendant la maladie ou la vaccination.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : cellules sentinelles, immunité; immunologie, cellules dendritiques, vaisseaux lymphatiques, organes lymphoides secondaires, lymphocyte T, lymphocyte B, CMH, MARCH, BAD-LAMP, C20orf103, LAMP5, PPP1R15a, eIF2a, système immunitaire,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #14 :

Equipe de recherche :

Développement du système immunitaire

Expertises :

Notre objectif est d’étudier la corrélation anatomique des structures en relation avec les ganglions lymphatiques et leur vascularisation lymphatique associée, et d’étudier le rôle des fibres nerveuses dans ce processus.
Etudier d’autres substances dans l’alimentation maternelle qui affectent la différenciation des acteurs clés impliqués dans la formation des ganglions lymphatiques. Ces études fourniront des informations sur l’ontogenèse et le fonctionnement de la famille ILC3 et fourniront des connaissances sur les conditions requises pour la formation des ganglions lymphatiques embryonnaires.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : immunité innée, système immunitaire, cellules dendritiques, cellules polynucléaires, monocytes, macrophages, granulocytes, cellules NK, lymphocyte T, ILC3, ILC1s, cytokine IFNγ, GATA-3, tissus lymphoïde, ganglions lymphatiques, acide rétinoïque,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #15 :

Equipe de recherche :

Immunosurveillance du système nerveux central

Expertises :

Elucider la complexité et la plasticité remarquables des cellules sentinelles de l’immunité afin de comprendre leur rôle dans la santé et dans la maladie.
Nous développons ainsi de nouvelles stratégies pour contrôler la neuroinflammation et la neuroinvasion en ciblant des sentinelles immunitaires méningées telles que les macrophages. Parce qu’ils représentent les premiers répondeurs situés à la surface du cerveau, la compréhension de leur mécanisme d’action est cruciale si l’on veut affiner la cinétique et l’amplitude de l’infiltration immunitaire du SNC. Cette information est également importante pour le développement de thérapies favorisant la clairance microbienne sans provoquer une neuroinflammation délétère.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : cellules sentinelles, système immunitaire, neuroinflammation, immunité innée, immunité innée méningeale, SNC, méninges, cellules lymphoïdes, maladie auto-immune, sclérose en plaque, SEP, CD4 + T helper 17, T-bet, Encéphalomyélite Auto-immune Expérimentale, NKp46+,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #16 :

Equipe de recherche :

Les cellules lymphoïdes innées et la régulation neuronale de l’immunité

Expertises :

Nous étudions le rôle ce ces interactions neuro-immunes dans différentes pathologies telles que le choc septique, des infections virales ou des lésions de la peau. Deux aspects principaux de ces régulations neuro-immunes sont disséquées:
– le rôle des hormones du stress, produites par la voie hypothalamo-hypophysaire-surrénalienne (ou HPA) et par le système nerveux sympathique.
– le rôle des neurones sensoriels impliqués dans la sensibilité à la douleur.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : cellules lymphoides innées, régulation neuronale, SNC, systèmre immunitaire, processus inflammatoire, hormones du stress, hypothalamo-hypophysaire-surrénalienne, immunooncologie,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #17 :

Equipe de recherche :

Equipe détachée

Expertises :

Compréhension des voies de signalisation cellulaire et des mécanismes transcriptionnels qui régulent la polarisation fonctionnelle des macrophages et des cellules dendritiques (DC) dans l’inflammation et l’immunité.
NF-kappaB et voies de signalisation associées dans la maturation fonctionnelle des DC dans la tolérance et l’immunité.
Ontogénie et fonction des macrophages associés aux tumeurs (TAM) et leur contribution à la progression du cancer.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : mécanisme transcriptionnel, signalisation cellulaire, macrophage, cellules dendritiques, TLR, inflammation, immunité, Nuclear Factor-kappaB, NF-kappaB, tumeur, cancer, IKKbeta, DC tolérogènes, Treg,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #18 :

Equipe de recherche :

Equipe détachée :

Expertises :

Dissection moléculaire de la biologie des cellules lymphoïdes innées avec un intérêt particulier pour les cellules Natural Killer (NK).

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : natural killer, cellules lympoides, T-bet, GATA3, BCL11B, GFI1, amphiréguline, AREG, RORγt, ILC,

Date de mise à jour :


Pôle / Axe #19 :

Equipe de recherche :

Equipe détachée

Expertises :

Notre recherche se situe à l’interface de l’immunologie et de la recherche sur les cellules souches. Nous étudions les mécanismes moléculaires et cellulaires de l’auto-renouvellement et du choix du destin cellulaire qui guident la différenciation des cellules souches hématopoïétiques en macrophages, des cellules jouant un rôle important dans l’immunité et la régénération tissulaire.

Nous nous intéressons à la régulation de ces processus par des facteurs de transcription, notamment de la famille Maf. Actuellement, nous développons des projets de recherche étudiant l’engagement de la lignée des cellules souches hématopoïétiques, l’auto-renouvellement et la reprogrammation dans les macrophages matures et le rôle des sous-types de monocytes/macrophages dans l’inflammation et la régénération tissulaire.

Ressources :

Plateforme Bioinformatique;
Plateforme Génomique fonctionnelle de C. elegans;
Cytométrie : 96 ou 384 puits;
Cytométrie : Trieurs : Aria III upgrade 4 lasers 17 couleurs / Aria III SORP 5 lasers, 18 couleurs / Influx 4 lasers 15 couleurs;
Cytométrie : analyseurs : Canto II (Anakin) 3 lasers 8 couleurs / Canto II (Yoda) 3 lasers 8 couleurs / LSR II (561) 4 lasers 16 couleurs / LSR II (UV) 4 lasers 18 couleurs / LSR Fortessa X-20
5 lasers 18 couleurs;
Cytométrie : analyse de données : flowjo (MAC) / Diva (PC) / Infinicyt (PC);
Plateforme génomique : PCR quantitative en temps réel (bulk et single-cell) / 3 machines qPCR / 1 Fluidigm Biomark + 3 IFC Controllers;
Plateforme génomique : Quantification, control qualité ARN/ADN 2 NanoDrop / 1 Qubit / 1 Agilent Bioanalyzer;
Plateforme génomique : Capture single-cell haut-débit / 10x Genomics Chromium;
Plateforme Histologie :
1 station de déshydratation
1 station d’enrobage
1 microtome
3 Cryostats
1 vibratome
1 système Cryojane;

Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscopie spectrale confocale à balayage laser : LSM 880 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection + Fast AiryScan and lasers at 405, 458, 488, 561, 633nm.
LSM 780 with 32 GaAsP detector + 2PMTs + spectral detection and lasers at 405, 440, 458, 488, 561, 633nm;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : Microscope video : Observer Z.1 Zeiss with Hamamatsu ORCA Flash 4.0 LT+ sCMOS camera and 37°C and CO2 chamber, Definite focus;
Plateforme IMAGIMM : image cellulaire : imagerie de phase Phasics SID4BIO on the Zeiss Cell Obsever (see the videomicroscopy part);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : microscope multiphoton Leica SP5 MP with Coherent Ultra II and OPO Chameleon (140fs pulse width);
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : Microscopie à feuille de lumière UltraMicroscope II from LaVisionBiotec;
Plateforme IMAGIMM : Imagerie intravitale et de grands échantillons : scanner à diapositive Pannoramic SCAN II with DAPI/A488/A555/A647 fluorescence cube;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Nikon Ti Eclipse microscope with Andor Ixon 897 camera, Coherent Obis 405 and Innova-70C lasers;
Plateforme IMAGIMM : imagerie moléculaire : Nanoscopie / Suivi de particule unique : Spectroscopie de corrélation de fluorescence/récupération de fluorescence après photoblanchiment Zeiss Axiovert 200M x2, Coherent Innova-70 and Sapphire lasers, Perkin Elmer SPCMs and incubation boxes;
Plateforme IMAGIMM : logiciel : Unsupervised particle LOCalization (UNLOC) developed on Matlab and ImageJ by the He&Marguet & PhyTI teams / Methods for Automated and Accurate Analysis of Cell Signals (MAAACS) / Multiple Target Tracing (MTT) developed on Matlab by the H&M team, dedicated to single molecule analysis (SPT) / A shiny application to analyze tissue section imageS (SAPHIR);

Projets majeurs :

Type(s) de collaboration recherchée(s) :

Mots clefs : immunologie, cellules souches, auto-renouvellement, CSH, régénération tissulaire, Maf, macrophage, inflammation,

Date de mise à jour :